Fjernelsen og fragmenteringen af levesteder på grund af menneskelig aktivitet - afskovning og dræning af vådområder til fordel for landbrug, urbanisering og etablering af industrier - udgør den største trussel mod dyre- og plantearter.

Andre trusler er overudnyttelse (overfiskeri og for intensiv jagt) og forurening. Også af mennesker introducerede invasive arter kan udgøre en trussel. Desuden spiller klimaforandringer en stadig større rolle.

I IUCNs (International Union for Conservation of Nature) Røde Liste er der 26.197 arter af truede dyr og planter, herunder mere end 8000 hvirveldyrarter, der er sårbare, truede eller stærkt truede (2386 fisk, 2100 padder, 1469 fugle, 1215 krybdyr og 1204 pattedyr).