Fjerning og fragmentering av habitater på grunn av menneskelig aktivitet - avskoging og drenering av våtmarker til fordel for landbruk, urbanisering og etablering av industrier - utgjør den største trusselen mot dyre- og plantearter.

Andre trusler inkluderer overutnyttelse (overfiske og for intensiv jakt) og forurensning. Også fremmede arter introdusert av mennesker kan utgjøre en trussel. Videre spiller klimaendringer en stadig større rolle.

På IUCNs (International Union for Conservation of Nature) røde liste er det 26.197 arter av truede dyr og planter, inkludert mer enn 8000 arter av virveldyr som er sårbare, truede eller kritisk truede (2386 fisk, 2100 amfibier, 1469 fugler, 1215 reptiler og 1204 pattedyr).